Основна причина ІЦН – механічні пошкодження шийки матки: розриви під час пологів, травми під час накладення щипців; хірургічні втручання: конізація, ампутація – тобто ситуації, коли шийку було вкорочено; аборти, якщо було неправильно проведено розширення цервікального каналу.
Найчастішими причинами короткої шийки матки є: недостатність прогестерону, вроджені аномалії розвитку, операції на шийці матки, ендоцервіцит, істміко-цервікальна недостатність (ІЦН), дисплазія сполучної тканини (ДСТ) 5.
індивідуальні особливості будови статевих органів конкретної жінки; гормональний баланс (концентрація жіночих статевих гормонів – естріолу та прогестерону); вага плода (або плодів у разі багатоплідної вагітності), що здійснює тиск на шийку матки; наявність маткових патологій, травм та інших дефектів.