Орнідазол приймають внутрішньо після їди, запиваючи достатньою кількістю води. Дорослим та дітям з масою тіла понад 35 кг по 1 таблетці 2 рази на добу (вранці та ввечері) протягом 5 днів. Щоб усунути можливість повторного зараження, статевий партнер завжди повинен отримати такий же курс лікування.
Орнідазол ефективний щодо Trichomonas vaginalis, Entamoeba histolytica, Giardia lamblia (Giardia intestinalis), а також деяких анаеробних бактерій, таких як Bacteroides spp. та Clostridium spp., Fusobacterium spp., та анаеробних коків: Peptostreptococcus spp.
Максимальна концентрація орнідазолу у крові спостерігається вже через 3 години після його перорального прийому, причому з білками плазми крові зв'язується менше 15% препарату, що надійшов усередину. При курсовому лікуванні препарат акумулюється в організмі.
Орнідазол має кращі фармакокінетичні параметри, ніж метронідазол, і дозволяє зменшувати тривалість лікування, не знижуючи його ефективності, а також має кращу переносимість та комплаентність.